M.Sc. Biophysik Studentin · Humboldt-Universität zu Berlin
Systembiologie | Systemmedizin | Computergestützte Pharmakologie
Ein interaktives webbasiertes Werkzeug zur Visualisierung von Finite-Elemente-Methode (FEM) Simulationsergebnissen mit Fokus auf biomedizinische Anwendungen. Entwickelt im Rahmen von DFG SPP 2311 und als Open-Source-Python-Paket über PyPI verfügbar.
CNN-basierte Vorhersage der mittleren Ribosomenlast (MRL) aus 5′-UTR-Sequenzen zur Untersuchung, wie eine reduzierte Polysom-Profiling-Auflösung die Modellleistung beeinflusst. Trainiert auf 280.000 Sequenzen mit 5-facher Kreuzvalidierung über fünf Auflösungsschemata; Modellinterpretation via Integrated Gradients (Captum).
Interaktive Webanwendung, die den digitalen Zwilling von Glimepirid für eine personalisierte und stratifizierte Diabetesbehandlung implementiert, gebaut mit Marimo und via Docker deploybar. Begleitet das Glimepirid-PBPK/PD-Modell und die zugehörige Publikation in Frontiers in Pharmacology.
Physiologisch-basiertes pharmakokinetisches (PBPK) Modell von Glimepirid im SBML-Format, einschließlich Leber-, Nieren-, Darm- und Ganzkörper-Teilmodellen. Begleitet von einem COMBINE-Archiv, FAIR-Bewertung und reproduzierbarer Simulations-Pipeline.
Entwicklung eines Ganzkörper-PBPK-Modells für Glimepirid basierend auf kuratierten klinischen Daten, zur Untersuchung der pharmakokinetischen Variabilität aufgrund von Nieren- und Leberfunktionsstörungen, Körpergewicht und CYP2C9-Genvarianten.